Trung tâm Tin học Trường Đại học Thủy Lợi được thành lập theo quyết định số 378 QĐ/TCCB-LĐ vào ngày 24 tháng 8 năm 1992 do Bộ Thủy Lợi (nay là Bộ Nông nghiệp và Phát triển Nông thôn) ban hành. Với hơn 30 năm xây dựng và phát triển, Trung tâm đã không ngừng mở rộng về quy mô và nâng cao chất lượng hoạt động nhằm đáp ứng nhu cầu ngày càng cao về tin học ứng dụng trong lĩnh vực tài nguyên nước. Ngày 8 tháng 6 năm 2005, Trung tâm được kiện toàn theo quyết định số 368 QĐ/ĐHTL-TCCB của Trường Đại học Thủy Lợi, với mục tiêu tiếp tục thúc đẩy các hoạt động nghiên cứu, phổ biến, và ứng dụng tin học trong nhiều lĩnh vực liên quan.